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Année : 2013
Tome : 164
Volume : 2
Pages : 67-71
Titre : Séquence partielle du fragment du gène ORF1b des souches du virus de l'artérite équine détectées en Turquie et analyse phylogénique
Auteurs : V. S. ATASEVEN, T. Ç. OGUZOGLU, Z. KARAPINAR, S. BILGE-DAGALP
Résumé : L'objectif de cette étude a été d'établir les séquences partielles du gène ORF1b de 9 souches du virus de l'artérite équine provenant de chevaux atteints d'affections respiratoires pour la première fois en Turquie. Le séquençage partiel des produits de PCR du gène ORF1b obtenus en utilisant des amorces spécifiques du virus de l'artérite équine, amplification et purification a été réalisé et a permis de comparer les séquences obtenues avec d'autres souches virales américaines et européennes précédemment identifiées en vue d'établir une analyse phylogénique. Les souches virales turques sont apparues étroitement reliées aux souches originaires d'Amérique du Nord et ont montré une forte hétérogénéité avec les souches européennes. De plus, les souches turques se sont avérées homogènes entre elles et ont été regroupées dans un même cluster. Cette étude constitue une première étude de la génétique des souches du virus de l'artérite équine en Turquie et servira de base à des études ultérieures d'épidémiologie moléculaire.
Mots clés : Virus de l'artérite équine, caractérisation moléculaire, ORF1b, séquence, analyse phylogénique, Turquie
Correspondance : V. S. ATASEVEN
Adresse : Department of Virology, Faculty of Veterinary Medicine, Mustafa Kemal University, 31040 Tayfur Sökmen Kampüsü, Hatay, TURKEY. Author corresponding : soydalata@hotmail.com
Liens : pdf

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